Projekt Hrvatske zaklade za znanost (2018-2023)

U posljednja dva desetljeća globalno širenje oomicetnih patogena u slatkovodnim ekosustavima uzrokuje smanjenje brojnosti mnogih populacija. Istovremeno, oomicetni patogeni uzrokuju značajne ekonomske gubitnike u slatkovodnoj akvakulturi. Osnovni cilj projekta je poboljšati razumijevanje ekologije oomicetnih patogena u slatkovodnim ekosustavima. Kao modelni organizmi koristit će se dva patogena oomiceta – Aphanomyces astaci i Saprolegnia sp. A. astaci je kao uzročnik račje kuge odgovoran za nestanak brojnih populacija zavičajnih deseteronožnih rakova u Europi i time je goruća tema u području konzervacije rakova. Oomiceti iz roda Saprolegnia uzročnici su saprolegnioze – bolesti pastrve i drugih salmonidnih riba značajnih za slatkovodnu akvakulturu u Hrvatskoj i svijetu. Primjenom interdisciplinarnog pristupa u kojem će se preklopiti moderne kemijske, molekularno-biološke, mikrobiološke i bioinformatičke metode, projekt će odgovoriti na nekoliko međunarodno relevantnih i do sada neistraženih pitanja. Dobiveni rezultati donijet će nova fundamentalna znanja o interakcijama oomicetnih patogena i njihovog okoliša te istražiti nove metode njihove kontrole.

Ciljevi projekta (C1 – C4):

C1 – Uzgojiti i analizirati izolate oomiceta patogena u ribnjacima pastrve u Hrvatskoj. Sakupljeni izolati bit će korišteni u slijedećim etapama provođenja projekta.

C2 – Istražiti kako sustav vode utječe na uspješnost sporulacije oomicetnih patogena A. astaci i Saprolegnia sp. Identificirati kemijske i mikrobiološke osobine prirodnih voda koje potiču odnosno inhibiraju stvaranje zoospora oomicetnih patogena. Temeljem toga će se u budućnosti preko analize vode moći pretpostaviti koliki je rizik od širenja/izbijanja bolesti uzrokovanih oomicetima u prirodnim i akvakulturnim okolišima. 

C3 – Selekcionirati, izolirati i karakterizirati nepatogene mikroorganizme koji se prirodno nalaze na/u domaćinu te pokazuju inhibicijsku aktivnost prema patogenim oomicetima A. astaci i Saprolegnia sp. 

C4 – Istražit će se da li ekstrakti mediteranskog samoniklog bilja imaju potencijal upotrebe kao mjera kontrole patogenih oomiceta u akvakulturi – sposobnost inhibicije rasta micelija i/ili inhibicije sporulacije oomiceta A. astaci i Saprolegnia sp.